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This research develops approaches and strategies in Bioinformatics with explicit attention to applications of Computational Biology. The plan is to develop structural motifs retrieval into the protein database (PDB). The aim here is of exploiting the Generalized Hough Transform for the comparison and the search of structural similarity. Note that, if the searched structure is just a component of a protein (like a structural motif or a domain) the same method supports the detection and the statistical distribution of these components, possibly answering questions of permanence among different species and phylogenetic questions related to biological homology.
Protein structural motifs search in protein data base
This research develops approaches and strategies in Bioinformatics with explicit attention to applications of Computational Biology. The plan is to develop structural motifs retrieval into the protein database (PDB). The aim here is of exploiting the Generalized Hough Transform for the comparison and the search of structural similarity. Note that, if the searched structure is just a component of a protein (like a structural motif or a domain) the same method supports the detection and the statistical distribution of these components, possibly answering questions of permanence among different species and phylogenetic questions related to biological homology.
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Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: http://hdl.handle.net/11367/30589
Citazioni
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simulazione ASN
Il report seguente simula gli indicatori relativi alla propria produzione scientifica in relazione alle soglie ASN 2021-2023 del proprio SC/SSD. Si ricorda che il superamento dei valori soglia (almeno 2 su 3) è requisito necessario ma non sufficiente al conseguimento dell'abilitazione. La simulazione si basa sui dati IRIS e sugli indicatori bibliometrici alla data indicata e non tiene conto di eventuali periodi di congedo obbligatorio, che in sede di domanda ASN danno diritto a incrementi percentuali dei valori. La simulazione può differire dall'esito di un’eventuale domanda ASN sia per errori di catalogazione e/o dati mancanti in IRIS, sia per la variabilità dei dati bibliometrici nel tempo. Si consideri che Anvur calcola i valori degli indicatori all'ultima data utile per la presentazione delle domande.
La presente simulazione è stata realizzata sulla base delle specifiche raccolte sul tavolo ER del Focus Group IRIS coordinato dall’Università di Modena e Reggio Emilia e delle regole riportate nel DM 589/2018 e allegata Tabella A. Cineca, l’Università di Modena e Reggio Emilia e il Focus Group IRIS non si assumono alcuna responsabilità in merito all’uso che il diretto interessato o terzi faranno della simulazione. Si specifica inoltre che la simulazione contiene calcoli effettuati con dati e algoritmi di pubblico dominio e deve quindi essere considerata come un mero ausilio al calcolo svolgibile manualmente o con strumenti equivalenti.